Jedan od njegovih “muzičkih” prijatelja je i Šejn Makgouen (Shane MacGowan) iz grupe The Pogues, na čijem je prvom solo albumu Dep svirao. Preciznije, na ovoj pjesmi.
Dalje, Džoni je bio član grupe P (ili supergrupe, kako je to danas popularno reći), a bend su pored njega činili pjevač Gibi Hejns (Gibby Haynes) iz Butthole Surfers, basista Fli (Flea) iz Red Hot Chili Peppers i gitarista Stiv Džouns (Steve Jones) iz Sex Pistols.
Pored gitare, Depu nije strano sjesti za bubnjeve, pa je tako oba instrumenta svirao na obradi “You're So Vain” Karl Sajmon (Carly Simon), koja se našla na albumu “Born Villain” grupe Marilyn Manson, kao bonus pjesma. Naravno, Džoni je nekoliko puta nastupao i sa frontmenom ove grupe.
Takođe, Džoni je pokazao svoje gitarsko umijeće kao pridružni član supergrupe The New Basement Tapes, a svirao je na pjesmi “Kansas City” sa albuma “Lost on the River”, koju u originalu izvodi Bob Dilan (Bob Dylan). Dep je u bendu zamijenio Elvisa Kostela (Elvis Costello), jer ovaj nije mogao prisustvovati snimanje pomenute pjesme, zbog ranije zakazanog koncerta.
Nešto kasnije, holivudski glumac će oformiti svoju supergrupu Hollywood Vampires sa Elisom Kuperom (Alice Cooper) i Džoom Perijem. Ekipa je objavila istoimeni debitantski album 2015. godine, na kojoj se našlo 11 klasičnih rok obrada, ali i dvije nove pjesme (koje je primarno napisao Dep), dok je za narative bio zadužen legendarni Kristofer Li (Christopher Lee).
